BEÜ'de RAD Sekanslama: Kütüphane Hazırlığından Veri Analizi Başlıklı Çalıştay Düzenlendi Bülent Ecevit Üniversitesi Biyoloji Bölümü bünyesinde 2 gün süren “RAD sekanslama: kütüphane hazırlığında veri analizi” başlıklı çalıştay gerçekleşti. Hibrit olarak gerçekleştirilen çalıştayda dersler çevrimiçi olarak yayınlandı. Çalıştaya aralarında Boğaziçi ve Koç Üniversitelerinin de yer aldığı yurtiçinden birçok üniversite ile Ukrayna ve Gürcistan’dan da araştırmacılar katıldı. Toplamda 3 ülke 14 üniversiteden katılım ve araştırmacların katılım sağladığı çalıştay 08-09 Şubat tarihlerinde gerçekleşti. Çalıştayın konusu olan “sekanslama yoluyla genotipleme (Genotyping-by-sequencing)”, organizmaların tüm genomlarının yalnızca küçük bir kısmından bilgi elde edilerek popülasyonların genetik yapısı ve evrimsel geçmişleri hakkındaki araştırma sorularını ele almak için kullanılan oldukça güçlü bir araçtır. Bir yaklaşım olan Kısıtlama Bölgesi İlişkili DNA dizilimi (RAD-seq), model olmayan organizmalara bile genom yapıları hakkında önceden bilgi sahibi olmamızı sağladığından oldukça popüler bir metottur. RAD-seq, mikrosatellitler gibi daha 'geleneksel' yöntemlere kıyasla yüz kat daha faydalı bilgiler sunar ve küçük araştırma laboratuvarları tarafından gerçekleştirilebilir. Çalıştay sırasında, deneysel tasarım, reaktiflerin tedariki, ıslak laboratuvar (wet-lab) protokolleri, dış kaynaklı sıralama ve veri analizi ile başlayarak potansiyel RAD-seq projesinin tüm aşamaları ele alındı. Bu adımların Türkiye'de başarılı bir şekilde uygulanmasına ilişkin Dr. Öğr. Üyesi Alexey Yanchukov tarafından yürütülen "Kör farelerin (Spalax ve Nannospalax) tüm yayılış alanında tüm genom kapsamında türleşmelerinin ve adaptif yayılışının filogenetik tarihi" TÜBİTAK 1001 119Z400 kodlu projesindeki deneyimlerimize dayanan pratik örnekleri katılımcılarla paylaşıldı. Aynı zamanda, RAD-seq uygulamaları hakkında genel bir bakış açısı sunulduğu ve belirli araştırma sorularına göre verileri analiz etmenin birkaç alternatif yolunu gösterildiği çalıştay, öncelikle Yeni Nesil DNA Dizileme yaklaşımını Türkiye'deki çalışmalarına dahil etmek isteyen, kariyerlerinin ilk aşamalarındaki araştırmacılara yönelik verimli bir şekilde gerçekleştirildi. Biyoloji bölümü olarak süreçte verdikleri destekten ötürü Fen-Edebiyat Fakültesi Dekanı Prof. Dr. Kemal Büyükgüzel’e ve Rektör Prof. Dr. Mustafa Çufalı’ya teşekkür ederiz.